Lentvaris yra sena gyvenvietė, esanti Pietryčių Lietuvoje. 1949 m. Lentvariui suteiktas miesto statusas. Tačiau šiame mieste buvo tik rusų mokykla, įsteigta 1896 m., kai Lietuva priklausė Rusijos imperijai, kurioje mokėsi ir lenkiškos klasės. 
Tik 1950 m. buvo atidarytos lietuviškos klasės, kurios sudarė septynmetę mokyklą. Mokykla buvo atidaryta buvusiame statybininkų bendrabutyje, netoli „Kaitros“ gamyklos.

1963 metais rugsėjo 1dieną LTSR švietimo ministro įsakymu, tarpininkaujant mokytojui Motiejui Šimelioniui, buvo atidaryta lietuviška mokykla Lentvaryje. Ji vadinosi Lentvario m. 2 - oji vidurinė mokykla. Direktoriumi dirbo Kęstutis Kudaba, pavaduotojais – M. Šimelionis ir L. Margevičienė. 1963/1964 m. m. mokėsi 429 mokiniai, veikė 18 klasių, dirbo 27 mokytojai – A. Veclovienė, G. Valašinienė, J. Šimonienė, M. Jonytytė, Špukienė, A. Miežinskaitė, V. Kunickas, A. Mizeraitė, J. Jankevičius, A. Budrikaitė, N. Tumosaitė, V. Žurauskaitė, I. Dikčienė, K. Janulis, V. Kriaučiūnienė, S. Nešakotienė, B. Jankevičienė, J. Šimkauskaitė, J. Skripitienė, M. Garšvienė, E. Veršelienė, A. Janulienė, N. Kudabienė, D. Barkauskaitė.

Pirmasis mokyklos direktorius Kęstutis Kudaba

Prie senosios lietuvių mokyklos. Direktorius P. Karlonas,
mokslo dalies vedėjas M. Šimelionis,
direktoriaus pavaduotoja G. Valašinienė
Nuo 1968 m. lituanistų, ypač G.Valašinienės, iniciatyva mokykloje kiekvienų metų pavasarį vykdavo tautinės vakaronės - subatvakariai. Jiems ruošdavosi visa mokykla: susiieškodavo tautinius drabužius, mokydavosi liaudies dainų, patarlių, mįslių, tautinių šokių. Šie vakarai buvo teminiai, pvz.: „Paukščiai lietuvių tautosakoje“, „Duona lietuvių tikėjime“, „Lietuvių tarmės“. Tai buvo tikros lietuviškos vakaronės su etnografiniais valgiais ir gėrimais, papročiais. 1969/1970 m.m. mokykloje buvo įvesti įvairių dalykų fakultatyvai. Vienas iš jų – Lietuvos istorijos, kuris vėliau tapo jaunųjų kraštotyrininkų būreliu. Šio fakultatyvo ir būrelio vadovė – N.Ivanauskienė. Mokykla garsėjo gerais sportininkais ne tik rajone, bet ir respublikoje. Tai kūno kultūros mokytojo A.Andrikio nuopelnas. 1971/1972 m.m. mokykloje mokėsi jau 920 mokinių. Ypatingai gausios buvo pirmosios klasės. Vienuoliktosios klasės buvo dvi, ir jose mokėsi 34 abiturientai. Todėl mokyklos administracija, profsąjungos organizacija, mokinių tėvai ieškojo būdų, kaip pastatyti naują, modernesnę mokyklą. Padedant Trakų Vykdomajam Komitetui, Švietimo skyriui, mokyklą šefuojančiam Lentvario kilimų fabrikui naujos mokyklos statybos darbai buvo pradėti 1973 m. žiemą.

1973 m. gruodžio 20d. Klevų alėjoje dedamas pirmasis pamatinis akmuo Lentvario naujai lietuvių mokyklai, į kurios pamatus įmontuotas laiškas būsimoms kartoms.
Kalba M. Šimelionis, šalia A.Andrikis

Statant mokyklą aktyviai dalyvavo ir mokytojai su mokiniais. 1975 m. vasario 1d. mokykla persikėlė į dabartinį pastatą – Klevų alėja 26. Čia galėjo mokytis 1280 mokinių, buvo dirbama kabinetine sistema.

Mokykloje buvo gerai organizuota užklasinė veikla. Ypač aktyvūs buvo turistai, vadovaujami A.Bacevičiaus, E.Stankūnienės suburti jaunieji geologai. Rajone buvo gerai žinomi E.Aliukonytės vadovaujami chorai.

1985 m. rugsėjo 1d. iki 1990 m. mokyklai vadovavo Nijolė Paulavičiūtė. Jos pavaduotojais dirbo O.Žilinskaja, J.Mišeikis, S.Momgaudienė. Šiuo laikotarpiu ypač daug dėmesio buvo skiriama mokyklos estetiniam vaizdui. Buvo suremontuota mokykla, kabinetai aprūpinti naujais baldais, sutvarkyta Aktų salė, valgykla, pradinių klasių foje, mokytojų kambarys, mokyklos laiptinė pasipuošė vitražu. 1988m. jaunieji geologai, vadovaujami E.Stankūnienės, įkūrė Geologijos kiemelį, kuriame yra 64 apylinkėse rasti rieduliai. Įkurtas pirmasis Lietuvoje geologijos muziejus.

1989 m. Lentvario 2-oji vidurinė mokykla buvo pavadinta lituanisto, Lentvario lietuvių mokyklos įkūrėjo Motiejaus Šimelionio vardu.

Nuo 1990 m. rugsėjo 1d. iki 1991 m. spalio 1d. mokyklai vadovavo Algirdas Lučiūnas. Jo pavaduotojais dirbo J.Mišeikis, O.Žilinskaja ir V.Rukšėnas.

1991m. spalio mėn. mokyklai vadovauti ėmėsi Romutė Nargelienė. Jos pavaduotojais dirbo O.Žilinskaja, O.Kanaševičienė ir A.Kazurienė. 1992 m. mokykla pasirašė bendradarbiavimo sutartį su Vokietijos Wipperfürth‘o gimnazija ir bendradarbiauja iki šiol. Vykdo projektus: R.Boscho fondo – „Tiltai“, Rytų Vestfalijos žemės – „Keliai“. Nuo 1986m. veikia lėlių teatro būrelis „Pasaka“, vadovaujamas mokytojos A.Kazurienės. Iš viso pastatyta 14 spektaklių-pasakėlių (vaikai ne tik vaidina, bet ir patys siūna lėles). Būrelis sėkmingai dalyvauja rajoninėse bei respublikinėse lėlių teatrų šventėse. 2001 m. gruodžio mėn. dalyvavo vaikų lėlių teatro šventėje „Karūna 2001“ ir vaidino Vilniaus „Lėlės“ teatre. 1997m. mokykloje visuomeniniais pagrindais susikūrė teatro studija, kurios repertuaras nuo renginių, skirtų valstybinėms šventėms, poetinių kompozicijų išaugo iki spektaklių.
2008 m., vadovaujantis LR švietimo ir mokslo ministro įsakymu, akredituota mokykloje vykdoma vidurinio ugdymo programa.
2008 m. liepos 15 d. Trakų r. savivaldybės tarybos sprendimu įsteigta Trakų r. Lentvario Motiejaus Šimelionio gimnazija.
Trakų r. Lentvario Motiejaus Šimelionio gimnazijos direktorės
PRIESAIKA
Palaimos šviesią valandą
Ar juodu nesekmės metu
Aš liksiu ištikimas žmogui
Ir sau pašiam.
Yra nematoma jungtis
Tarp mūsų visų širdžių,
Ir saulėtą dienovidį,
Ir nykųjį vidurnaktį
Aš ją jaučiu, aš ją girdžiu.
Po kasdienybės pelenais
Karšta rusena žarija
Kiekvieno mūsų širdyje.
Tegul ji skaidriai įsižiebs
Draugystės šildančiais jausmais
Palaimos šviesią valandą
Ir juodu nesekmės metu-
Ir tamsią naktį,
Ir šviesą dieną-
Būties akimirką
Kiekvieną...
Aš, Romutė Nargelienė, Lentvario Motiejaus Šimelionio gimnazijos direktorė, visų bendruomenės narių, garbių svečių, buvusių ir esančių mokytojų, gimnazistų akivaizdoje prisiekiu: sąžiningai vykdyti direktorės pareigas, visas savo jėgas, gebėjimus skirti gimnazijos garsinimui, turtinimui. Sieksiu, kad mūsų gimnazija taptų viena ryškiausių savo pasiekimais ir garsėtų gražiais darbais.
Tepadeda man Dievas!
Romutė Nargelienė
2008 m. lapkričio 14 d.
Trakų r. Lentvario Motiejaus Šimelionio gimnazijos mokinių priesaika
Mes I klasės mokiniai prisiekiame:
1. Ugdyti savo dvasinę kultūrą ir išprusimą.
2. Atkakliu darbu, kruopštumu, uolumu formuoti intelektualią, išsilavinusią mokyklos bendruomenę.
3. Savo pasiekimais garsinti gimtąjį miestą ir Trakų rajoną.
4. Siekti, kad atliktais darbais ir pasiektais rezultatais įrodytume, jog esame tikri Lietuvos piliečiai.
Te šviesa ir tiesa mūs žingsnius telydi.
Tepadeda mums Dievas.

